transparent gif

 

Ej inloggad.

Göteborgs universitets publikationer

Glycosaminoglycan Profiling in Patients' Plasma and Urine Predicts the Occurrence of Metastatic Clear Cell Renal Cell Carcinoma

Författare och institution:
Francesco Gatto (Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi, Chalmers); N. Volpi (-); H. Nilsson (-); Intawat Nookaew (Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi, Chalmers); M. Maruzzo (-); A. Roma (-); M. E. Johansson (-); Ulrika Stierner (Institutionen för kliniska vetenskaper, sektionen för onkologi, radiofysik, radiologi och urologi, Avdelningen för onkologi); Sven Lundstam (Institutionen för kliniska vetenskaper, sektionen för onkologi, radiofysik, radiologi och urologi, Avdelningen för urologi); U. Basso (-); Jens B. Nielsen (Institutionen för biologi och bioteknik, Systembiologi, Chalmers)
Publicerad i:
Cell Reports, 15 ( 8 ) s. 1822-1836
ISSN:
2211-1247
Publikationstyp:
Artikel, refereegranskad vetenskaplig
Publiceringsår:
2016
Språk:
engelska
Fulltextlänk:
Fulltextlänk (lokalt arkiv):
Sammanfattning (abstract):
Metabolic reprogramming is a hallmark of clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) progression. Here, we used genome-scale metabolic modeling to elucidate metabolic reprogramming in 481 ccRCC samples and discovered strongly coordinated regulation of glycosaminoglycan (GAG) biosynthesis at the transcript and protein levels. Extracellular GAGs are implicated in metastasis, so we speculated that such regulation might translate into a non-invasive biomarker for metastatic ccRCC (mccRCC). We measured 18 GAG properties in 34 mccRCC samples versus 16 healthy plasma and/or urine samples. The GAG profiles were distinctively altered in mccRCC. We derived three GAG scores that distinguished mccRCC patients with 93.1%-100% accuracy. We validated the score accuracies in an independent cohort (up to 18 mccRCC versus nine healthy) and verified that the scores normalized in eight patients with no evidence of disease. In conclusion, coordinated regulation of GAG biosynthesis occurs in ccRCC, and non-invasive GAG profiling is suitable for mccRCC diagnosis.
Ämne (baseras på Högskoleverkets indelning av forskningsämnen):
NATURVETENSKAP ->
Biologiska vetenskaper ->
Cellbiologi
Postens nummer:
238363
Posten skapad:
2016-06-27 14:03
Posten ändrad:
2016-07-12 08:41

Visa i Endnote-format

Göteborgs universitet • Tel. 031-786 0000
© Göteborgs universitet 2007