transparent gif

 

Ej inloggad.

Göteborgs universitets publikationer

Top 50 most wanted fungi

Författare och institution:
R. Henrik Nilsson (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Christian Wurzbacher (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Mohammad Bahram (-); Victor R. M. Coimbra (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Ellen Larsson (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Leho Tedersoo (-); Jonna S. Eriksson (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Camila Duarte (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Sten Svantesson (Institutionen för biologi och miljövetenskap); Marisol Sánchez-García (-); Martin Ryberg (-); Erik Kristiansson (Institutionen för matematiska vetenskaper, Chalmers/GU); Kessy Abarenkov (-)
Publicerad i:
MycoKeys, 12 s. 29-40
ISSN:
1314-4057
E-ISSN:
1314-4049
Publikationstyp:
Artikel, refereegranskad vetenskaplig
Publiceringsår:
2016
Språk:
engelska
Fulltextlänk:
Fulltextlänk (lokalt arkiv):
Sammanfattning (abstract):
Environmental sequencing regularly recovers fungi that cannot be classified to any meaningful taxonomic level beyond “Fungi”. There are several examples where evidence of such lineages has been sitting in public sequence databases for up to ten years before receiving scientific attention and formal recognition. In order to highlight these unidentified lineages for taxonomic scrutiny, a search function is presented that produces updated lists of approximately genus-level clusters of fungal ITS sequences that remain unidentified at the phylum, class, and order levels, respectively. The search function (https://unite.ut.ee/top50.php) is implemented in the UNITE database for molecular identification of fungi, such that the underlying sequences and fungal lineages are open to third-party annotation. We invite researchers to examine these enigmatic fungal lineages in the hope that their taxonomic resolution will not have to wait another ten years or more.
Ämne (baseras på Högskoleverkets indelning av forskningsämnen):
NATURVETENSKAP ->
Data- och informationsvetenskap ->
Bioinformatik (beräkningsbiologi)
NATURVETENSKAP ->
Biologiska vetenskaper
NATURVETENSKAP ->
Biologiska vetenskaper ->
Mikrobiologi
NATURVETENSKAP ->
Biologiska vetenskaper ->
Botanik
NATURVETENSKAP ->
Biologiska vetenskaper ->
Bioinformatik och systembiologi
NATURVETENSKAP ->
Biologiska vetenskaper ->
Biologisk systematik
LANTBRUKSVETENSKAPER ->
Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske ->
Jordbruksvetenskap
LANTBRUKSVETENSKAPER ->
Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske ->
Skogsvetenskap
LANTBRUKSVETENSKAPER ->
Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske ->
Markvetenskap ->
Markbiologi
LANTBRUKSVETENSKAPER ->
Veterinärmedicin ->
Patobiologi ->
Mikrobiologi och immunologi
Nyckelord:
Fungi, environmental sequencing, taxonomic orphans, metabarcoding, taxonomy feedback loop
Ytterligare information:
Open access
Postens nummer:
233475
Posten skapad:
2016-03-21 11:02
Posten ändrad:
2016-06-10 11:31

Visa i Endnote-format

Göteborgs universitet • Tel. 031-786 0000
© Göteborgs universitet 2007