transparent gif

 

Ej inloggad.

Göteborgs universitets publikationer

Bottom-up derivation of an effective thermostat for united atoms simulations of water

Författare och institution:
Anders Eriksson (Institutionen för fysik (GU)); Martin Nilsson Jacobi (Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori, Chalmers); Johan Nyström (Institutionen för energi och miljö, Fysisk resursteori, Chalmers); Kolbjörn Tunström (Institutionen för energi och miljö, Chalmers)
Publicerad i:
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, 130 ( 16 )
ISSN:
0021-9606
Publikationstyp:
Artikel, refereegranskad vetenskaplig
Publiceringsår:
2009
Språk:
engelska
Fulltextlänk:
Sammanfattning (abstract):
In this article we derive the effective pairwise interactions in a Langevin-type united atoms model of water. The interactions are determined from the trajectories of a detailed molecular dynamics simulation of simple point charge water. A standard method is used for estimating the conservative interaction, whereas a new "bottom-up" method is used to determine the effective dissipative and stochastic interactions. We demonstrate that when compared to the standard united atoms model, the transport properties of the coarse-grained model is significantly improved by the introduction of the derived dissipative and stochastic interactions. The results are compared to a previous study, where a "top-down" approach was used to obtain transport properties consistent with those of the simple point charge water model. © 2009 American Institute of Physics.
Ämne (baseras på Högskoleverkets indelning av forskningsämnen):
NATURVETENSKAP ->
Fysik ->
Atom- och molekylfysik och optik
Nyckelord:
dissipative particle dynamics, molecular-dynamics, potentials, systems
Postens nummer:
124939
Posten skapad:
2010-08-20 11:04
Posten ändrad:
2016-06-29 11:02

Visa i Endnote-format

Göteborgs universitet • Tel. 031-786 0000
© Göteborgs universitet 2007